申请互联网药品信息服务资格证书，应当遵循以下程序。

(一)申请企业必须首先登录国家食品药品监督管理局行政事项受理服务页面，新申请在线填写公司基本信息。填写完基本信息后，将生成国家美国食品药品监督管理局统一发布的《互联网药品信息服务申请表》。

(二)完成第一步后，根据各省市食品药品监督管理部门网上发布的网络药品信息服务申请服务指南，直接咨询各省市食品药品监督管理部门的有关要求，准备申请资料。

申请材料准备齐全后，可以根据各省市食品药品监督管理部门的不同要求，也可以在线申报，也可以通过窗口提交。从收到申请材料之日起，将在5个工作日内作出受理与否的决定。如果受理，将发出受理通知。如果不接受，通知申请人并解释原因。

(四)受理之日起20日内，各省市食品药品监督管理部门审查申请资料，作出同意或不同意的决定。同意的，发行《互联网药品信息服务资格证书》，报国家食品药品监督管理总局备案发布公告；如果不同意，将书面通知申请人并解释原因。